Le SNESUP-FSU a alerté depuis plusieurs semaines les autorités de tutelle (ministère de l'enseignement supérieur et de la recherche puis ministère de l'éducation nationale, de l'enseignement supérieur et de la recherche, préfecture, rectorat,...) afin qu'elles veillent à sa sécurité, et qu'il puisse exercer sereinement ses fonctions universitaires. La discrétion, nécessaire à un climat d'apaisement pour les personnels et les étudiants, est également indispensable afin que les procédures d'enquête en cours aillent à leur terme, et que la justice instruise cette affaire.
En outre, le SNESUP-FSU condamne fermement tout amalgame qui pourrait être fait, notamment par les médias, « entre les menaces de mort reçues par le directeur de l'IUT et des décisions du conseil d'institut ou d'un soi-disant mouvement islamiste au sein de l'établissement qui stigmatisent une communauté dans son intégrité et portent atteinte à la sécurité et au bon fonctionnement de l'institution » pour reprendre les termes de la déclaration de l'Assemblée Générale de l'IUT de Saint Denis du 20 mai 2014.